此世间出现了无数修持佛陀教证之法的高僧大德，其中在五浊恶世的最后一劫之福德、智慧衰微的众生之怙主，第二佛陀莲花王者，去了罗刹王国，持明君臣也随之解散，甚密精要的修持如残灯败星，执持真谛金字殿宇的东方噶陀吉祥大刹 土也变得微光黯淡。
这时候，具有殊胜悟性和圆满功德的瑜伽大自在行者仲巴•南卡嘉措降生于世间。无上功德大海圆满坛城显扬的大德们，他们一生为了教法和众生事业而如愿嬉戏变化，这是他们的本生法则。
最后，仲巴仁波切圆满了在这个刹上中度化有情众生的事业而示现圆寂。仁波切生前多次想去朝拜绒真卡瓦嘎圣地，他常说：“我若是能去绒真卡瓦嘎，寿命可以延长。这五蕴之身如果可以到达那个地方，缘起也是非常好的。” 即便这样，每次都受到当地官员和大师们的阻扰而未能如愿。邬金莲花大师有云：“雪域藏地的成就者我邬金巴，除了违背誓言者，谁都伤害不了我”。则勒智者白玛勒珠曾经给自己的弟子们制定以空行护法见证的禁酒令。可是个别僧侣没有遵守，悄悄在暗地里喝酒。具誓护法当坚多杰勒巴在梦里给智者示说，是这种背弃誓言的做法缩短他的寿命，还有白玛莱泽和噶玛林巴也相违空行母缘起缩短了寿命，嘉参宁波大师因错误的缘起预示而短寿。这样的历史故事很多。正如热拿林巴大师掘藏法《明镜开示》中写道的：“浊世中的弟子，不如法守持戒律,致上师缩短寿命，使自己堕入金刚地狱。故而应当珍惜梵行。” 仲巴仁波切的示寂也有这种因素。
木牛年时，仲巴仁波切就常说：“谁也不应该阻扰我圆寂。无论谁来阻扰，谁的寿命福德就会受到损失。” 故一直没有人恳请仁波切住世。但是火兔年，仁波切收到来自噶陀大持明才旺罗布的信函，函中说：“仲巴仁波切您不要寻思着只在今明年住世。为了众生事业，您要长久住世。” 看着信函，半晌，仲巴仁波切并不说话，实际上是上师表示不答应。
土龙年（1749年)，仲巴仁波切七十七岁，可是他却老说自己已经八十八岁，整整说大了十岁。六月十六日，仁波切把我叫到身边说：“如今我不一定常住。你看找一个地形殊胜的地界能完整地埋葬我的身体，这样比较好。”并说明这样做有利于众生，还说：“写信给道喇白玛罗布大师的转世噶陀大持明者，详细介绍我的情况，具体安排事宜可以向他请教。”
一个月之后，仁波切和一名侍者聊天时说：“我在定中很清楚地看到来世往生的佛刹。并且也清楚地观察到现在我的大多数眷众也投生到了那里，那佛刹就是铜色吉祥山（莲师刹土）。”仁波切没有继续说下去，隐瞒了自己的定境。
十一月中，仲巴仁波切给我和弟子们讲授了一些有关虹化身的重要殊胜教言，但是仁波切怕身边的弟子们伤心，所以没能细说。十九日晚上，出现了一些空行来迎接的祥兆。仲巴仁波切当时留有许多开示密意，却因奥义深邃，大部分我都无法表达。仁波切看着我说：“《莲花遗教》中说正法将繁荣昌盛，为什么那么说呢? ”我说：“《遗教》在哪里? ”仁波切回答说:“你没有听懂我说的意思。”有时候仁波切叫身边的弟子念诵莲师心咒，他默默念诵着《帕当巴祈愿文》。当天夜晚，仁波切始终保持着毗卢七支坐法。上半夜，让我们用坐垫抬起他依次面向东南西北，仁波切恭敬顶礼，心中默诵着回向和祈愿文。最后，又从东面绕到西面，然后叫我们停下。我们知道，仲巴仁波切是要驾归佛土了，弟子们心中非常紧张。仁波切叫我过去坐在他的身边，说：“哦，现在到了应该走的时候了。路是朝你那个方向的。”我向仁波切请教了一些有关法性中阴的问题，仁波切点点头，还是重复着前一句话。我根据《上师密意集合•窍诀共事十颂》中所说，念诵了《白色独胜》经，仁波切听后问道：“这是《上师密意集合》吗？ ”我答：“是《上师密意集合》里面的片段。”说着把用银粉誉写的《系解脱》放到仁波切手中，仁波切高兴地说：“啊，路没有错，最好的就是这个。”又说：“你面向四方念诵《系解脱》。”我依照仁波切的语旨，依次念诵了《白色独胜》、《智慧烈焰根本续》、《明镜金刚心髓•系解脱》、《静猛了义心髓•系解脱》等。此时仁波切仍然稳坐七支坐，那时听到了从虚空中传来了女子动听的歌唱声，还有美妙的琴声和笛子声，那是空行来迎接了。接着仁波切还修持了破瓦法，又说他口渴了，还喝了两口绛香茶，然后默诵密义，手印从莲花印绕到金刚持手印、威镇魔众手印、入定手印交替变换着，最后于二十一日这个良辰吉日交会的日子，在黎明时分，仲巴仁波切以右手压地印、左手平等印的姿势，示现意识融入法界之相。当时，我们开始着手准备一切供养，依照先贤智者们的教言,预设着能够利益后代的美好缘起。太阳出来时，传来一些美妙的声音，仿佛来自于牧群中， 纯净的天空蔚蓝如宝。这一天，从巴曲的泽绕山到西南方向的一大片天空，充满了彩云光环宝幢和彩云柱子。
在仲巴仁波切圆寂前夕，听到善神恋伤地显现出女子的哭泣声，大风猛厉地吹起，大批的护法鸟飞来，象征着地神和护法们也在为仲巴仁波切的离去而悲恸。
仲巴仁波切圆寂后的日子里，我们以真诚无伪的恭敬心和清净心修诵了《上师相应法祈愿文》、《静猛了义•系解脱》。
二十七日，依照仁波切的遗言，以曲嘉德道林巴大师的《大悲观世音仪轨》庄严法体的报身相。我们本想如此供奉一段时间，可是因为种种因缘，所以将法体请至黄金灵塔中供养了起来。那天天空晴朗无云，下午，云层中又充满了彩色光环。
登顿多杰转世罗布上师和曲雷上师修持了《密意坛城仪轨》、噶玛林巴大师的静猛法和《新掘藏八法》供养。晓萨上师邬金泽仁也来了。神变月上旬，在官员普扎的大力帮助下，修持了《圆寂宝瓶成就法缘起》。另外，从噶陀来了信雄仁波切眷众，从扎嘎來了扎嘎上师眷众，从柯日来了佛子白玛朗嘉。在这里聚集了无数金刚上师和僧众。德格土司索朗甘波也派来许多代表，供养了五百盏酥油灯和大量食子。土司安排将仲巴仁波切的法体请到噶陀去，可是为了遵从仲巴仁波切的遗言，我们还是打算等大持明者的指示。噶陀信雄仁波切等众弟子每天在法体旁进行供养和沐浴。我与仲巴仁波切身边的弟子们修持了掘藏大师登顿多杰的掘藏法《密意集合》中的《莲花生古茹颅髮者五部成就法》。
在仲巴仁波切的灵塔旁时常飘来阵阵扑鼻妙香，是非人和空行勇士们也在为上师敬献供养。
终于，法体恭送东方第二密严金刚座噶陀寺荼毗。现在噶陀寺依然保存着这位伟大的大成就者噶当巴大师意的化身仲巴•南卡嘉措上师的茶毗遗址，遗址不远处的一块平坦山石上清晰留有尊者法体荼毗过程中从火中飞出的天灵盖所击出的印痕，无量众生具足敬信在这里顶礼大恩金刚上师。
噫嘻
遍知觉者显化人身者
大恩法王南卡嘉措足
宛如释迦牟尼显真身
事业终极甚密圆满者
寂静之处示显度有情
空前未有幻显及空行
迎请祥瑞显示涅槃相
金刚大乘熟解宝瓶融
不灭教法宝幢亦降落
善道龙种诸众也悲伤
平常贪念执著弟子众
上师住时不求耳传法
如今拜见灵塔方恨晚
追求现有奸诈之诸友
大恩法王不在作何想
噫嘻
导师汝已示现融法界
浊世我众先贤佛难度
而今已成汝子之所度
大恩法王南卡何敢弃
菩提发心时常不削弱
寂静佛刹幻化之嬉戏
利益众生世间诸正法
祈愿宣说繁荣又昌盛
我以真诚的信心，在殊胜活佛多杰巴沃仁波切的敦促下，开始以偈颂写这篇《具信生喜》，述言多康噶陀金刚座历代仲巴仁波切中，我等怙主法王噶陀仲巴•南卡嘉措，这位美名宝幢远扬，名副其实的仲巴仁波切一生不平凡的事迹。仲巴仁波切圆寂后不久，多康噶陀金刚座狮子法座之座主信雄法王(康熙帝国师）要求我继续写完仲巴仁波切的传记,并送来哈达等。成为竹庆仁波切法子，智慧功德普天之博的三具金刚持晋美确竹朗嘉(又名晋美扎西嘉措），送来哈达开示说：“这篇偈句精悍短小，但许多人看了难以理解，所以请您用偈句白话相间的手法，详细写一篇仲巴仁波切的传记吧。”于是我难违其意，在藏历第十三胜生周土蛇年六月十日，由我邬金登巴书写完成。仲巴仁波切内外密事业无限，若大海之深广。我只能写一些外在的事迹，但无妄语捏造的污染，以恭敬和信心写就了这篇名叫《神奇天之妙音》的传记。愿此功德置一切众生于成熟解脱普贤金刚持吉祥上师之果位。
复颂
无缘慈悲遍及众生间
殊胜传记智者也难宣
增上了义福慧功德树
怙主本生花鬟明此处
（全文终）
回向偈
文殊师利勇猛智， 普贤慧行亦复然。
我今回向诸善根， 随彼一切常修学。
三世诸佛所称叹， 如是最胜诸大愿。
我今回向诸善根， 为得普贤殊胜行！